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Persona4の設定判別要素が少し判明したのでまとめました。
ベルベットCHANCEに設定判別要素があるようです。

ベルベットCHANCE中の全ナビ発生率

設定1 6.25%
設定2 10.0%
設定3 7.81%
設定4 12.5% 
設定5 10.9%
設定6 15.6%

ベルベットCHANCE中の継続ゲーム数20G選択率

設定1　　 10.00%
設定2　　 12.50%
設定3　　 10.00%
設定4　　 15.63%
設定5　　 12.50%
設定6　　 15.63%
 
偶数設定の方が全体的に優遇されているようですが、
継続ゲーム20G、全ナビ発生率の高さが組み合わされば、高設定の期待も高まるでしょう。